Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp19Q3UJD6 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms