Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf40Q3U319 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rnf40Q3U319 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rnf40Q3U319 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf40Q3U319 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf40Q3U319 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf40Q3U319 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnf40Q3U319 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf40Q3U319 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Rnf40Q3U319 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Rnf40Q3U319 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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