Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccndbp1Q3TVC7 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccndbp1Q3TVC7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccndbp1Q3TVC7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccndbp1Q3TVC7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms