Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms