Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms