Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trim71Q1PSW8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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