Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rpusd2Q149F1 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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