Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rundc1Q0VDN7 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms