Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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