Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GscQ02591 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.43
GscQ02591 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
GscQ02591 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
GscQ02591 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
GscQ02591 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms