Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Hoxd1Q01822 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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