Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gja5Q01231 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms