Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms