Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp1Q00915 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms