Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TgfbiP82198 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms