Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx2P81066 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx2P81066 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Usp10-202ENSMUST00000108988 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irx2P81066 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms