Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms