Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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