Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms