Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CgnP59242 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CgnP59242 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CgnP59242 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CgnP59242 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CgnP59242 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CgnP59242 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CgnP59242 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CgnP59242 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CgnP59242 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CgnP59242 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CgnP59242 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CgnP59242 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CgnP59242 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CgnP59242 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CgnP59242 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CgnP59242 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CgnP59242 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CgnP59242 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CgnP59242 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CgnP59242 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CgnP59242 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CgnP59242 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CgnP59242 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms