Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp25P57080 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp25P57080 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp25P57080 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp25P57080 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp25P57080 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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