Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rrp1P56183 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms