Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gbx2P48031 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx2P48031 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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