Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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SrprbP47758 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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