Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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LtbP41155 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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LtbP41155 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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LtbP41155 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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LtbP41155 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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LtbP41155 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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LtbP41155 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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LtbP41155 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbP41155 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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LtbP41155 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbP41155 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbP41155 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbP41155 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbP41155 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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LtbP41155 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbP41155 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbP41155 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbP41155 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbP41155 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbP41155 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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