Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Rpl28P41105 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Rpl28P41105 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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