Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms