Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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