Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NapbP28663 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NapbP28663 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NapbP28663 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NapbP28663 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NapbP28663 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NapbP28663 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NapbP28663 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NapbP28663 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NapbP28663 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NapbP28663 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NapbP28663 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NapbP28663 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NapbP28663 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NapbP28663 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NapbP28663 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NapbP28663 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NapbP28663 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NapbP28663 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NapbP28663 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NapbP28663 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms