Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Hoxd10P28359 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms