Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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