Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Fcer1aP20489 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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