Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P20040 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P20040 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P20040 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P20040 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P20040 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P20040 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P20040 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P20040 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P20040 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P20040 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P20040 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P20040 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P20040 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P20040 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P20040 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P20040 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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