Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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PdgfaP20033 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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PdgfaP20033 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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PdgfaP20033 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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