Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnnc1P19123 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnnc1P19123 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnnc1P19123 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnnc1P19123 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnnc1P19123 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnnc1P19123 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnnc1P19123 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnnc1P19123 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnnc1P19123 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnnc1P19123 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnnc1P19123 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnnc1P19123 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms