Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms