Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gata1P17679 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms