Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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