Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04224 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04224 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04224 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P04224 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P04224 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P04224 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P04224 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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