Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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