Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rnf13O54965 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Rnf13O54965 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Rnf13O54965 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Rnf13O54965 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Rnf13O54965 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf13O54965 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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