Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms