Protein–RNA interactions for Protein: O08705

Slc10a1, Sodium/bile acid cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a1O08705 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Slc10a1O08705 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Slc10a1O08705 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Slc10a1O08705 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Slc10a1O08705 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc10a1O08705 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms