Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm4340L7N2C4 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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