Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Gm8356J3QPD3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Gm8356J3QPD3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Gm8356J3QPD3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Gm8356J3QPD3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Gm8356J3QPD3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Gm8356J3QPD3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Gm8356J3QPD3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Gm8356J3QPD3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8356J3QPD3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
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