Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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Gm17577J3QNF7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Gm17577J3QNF7 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Gm17577J3QNF7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Gm17577J3QNF7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Gm17577J3QNF7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Gm17577J3QNF7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Gm17577J3QNF7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Gm17577J3QNF7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Gm17577J3QNF7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Gm17577J3QNF7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Gm17577J3QNF7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm17577J3QNF7 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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