Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms