Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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