Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms