Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb34-202ENSMUST00000113158 6602 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms